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CLC Main Workbench是一個(gè)用于高級 DNA、RNA 和蛋白分析的綜合性工作平臺 ，憑借著(zhù)獨特的圖形化操作介面，使得 CLC Main Workbench 的使用者不須具備特殊的電腦技能便可輕松的操作軟件。CLC Main Workbench 與大多數的 alignment 軟件不同，可在多條比對序列中直接標示單一序列的注解。這可以輕易地辨識 alignment 結果序列上有那些特定 domain 具有保守性。